一.开机
1.接通墙壁上的空气开关（主机和循环水）。
2.冷却循环水系统工作，设置水温为20℃。
3.打开电镜主机电源，真空系统自动运行，约30分钟后真空度达到工作需要，仪器处于待用状态。
二.样品安装
　　1.将装有铜网的样品杆插入样品室，打开预抽开关进行样品隔离室预抽，约2~3分钟后绿灯亮，然后顺时针转→推→转样品杆，最后缓慢送入观察位置。
　　2.取出样品前，先关闭灯丝电流，使样品恢复初始位置，然后向外抽→转→抽→转样品杆，关闭预抽开关，待放气后向外抽离镜筒。
三.图象获得
1.打开高压，待束流数值稳定，生物样品常选择高压值60kV(对应束流约33.2uA)。
2.打开灯丝电流开关，灯丝电流自动达到饱和，荧光屏上出现图像。
　　3.用控制面板上的放大倍率旋钮选择放大倍数，聚焦旋钮聚焦图像，亮度旋钮调节亮度。
四.镜筒合轴
　　1.按照标准合轴程序进行合轴。
　　2.在高倍模式下调整电压中心，5万倍以上进行物镜消象散操作。
五.底片安装
　　1.关闭灯丝电流和高压，对照相室放气。
　　2.取出两个底片盒，装入经过预抽室抽真空12小时以上的新底片盒，关闭照相室门自动抽真空。
六.观察和照相
　　1.移动样品，找到合适视野，放大至所需倍数，用小荧光屏仔细聚焦，观察图像无漂移，调整亮度至爆光时间为2秒(对应底片)或束流指示约1.2 uA(对应CCD拍照)。
　　2.在底片上输入样品名称等有关信息，按PHOTO按钮进行照相。
七.关机
　　1.依此关闭灯丝电流和高压，再关闭镜筒电源，最后关闭电镜主机电源。
　　2.待10分钟后，依次关闭总电源及墙壁上空气开关。
3.在记录本上记录使用情况。
注：1.用户未经过仪器操作培训并通过考核，不得独立操作仪器。
　　2.为确保仪器安全，更换样品、CCD照相等操作应由本室工作人员完成。
　　3.为保证仪器性能，镜筒合轴等操作应由仪器管理人员定期调试。
　　4.使用中若仪器出现故障，应立即停止使用，做好记录，并向仪器管理人员反映故障现象和出现故障前的操作内容，以方便故障的排除。